Степан Петрович Хадеев проходил службу на различных командных должностях. С августа 1941 по октябрь 1942 г. начальник ВВИА инженер-полковник С. П. Хадеев руководил восстановлением учебной и научно-исследовательской работы после ее перебазирования на новое место дислокации в г. Свердловск. По его инициативе при академии в помощь фронту были созданы курсы усовершенствования инженеров ВВС. Также при инженерном факультете был образован Ученый совет для приема и рассмотрения кандидатских диссертаций.

В ноябре 1942 г. С. П. Хадеев назначается начальником Харьковского военного авиационного технического училища (с 1948 г. — Харьковское высшее военное авиационное инженерное училище, с 1960 г. — Харьковское высшее военное командно-инженерное училище ракетных войск) и был им в течение 20 лет. На этой должности он ярко проявил свой талант военного руководителя, организатора учебного процесса, ученого, воспитателя.

Училище одним их первых в ВВС приступило к подготовке специалистов по эксплуатации реактивной техники, постоянно совершенствовало учебно- материальную базу, а профессорско-преподавательский состав поднял учебно- методическую работу на уровень, соответствующий традициям академий им. проф. Н. Е. Жуковского и А. Ф. Можайского.

Училище неизменно занимало одно из ведущих мест среди учебных заведений ВВС. С 1960 г. училище готовило специалистов для нового вида Вооруженных Сил — ракетных войск стратегического назначения, что потребовало полной перестройки его работы. Решение этой сложной задачи в кратчайшие сроки было осуществлено под руководством С. П. Хадеева.

Награжден орденом Ленина, 2 орденами Красного Знамени, орденом Трудового Красного Знамени, медалями СССР.