После успешного окончания академии Виктор Федорович Воскобоев служил на инженерных должностях в научно-исследовательском учреждении Министерства обороны. С 1967 г. обучался в адъюнктуре, по окончании которой защитил кандидатскую диссертацию и стал работать в академии старшим научным сотрудником, а затем начальником научно-исследовательской лаборатории. После успешной защиты докторской диссертации проходил службу в должности старшего преподавателя, а затем — заместителя начальника кафедры эксплуатации авиационного радиоэлектронного оборудования.

В. Ф. Воскобоев проявил себя высококвалифицированным специалистом в области технической эксплуатации и ремонта авиационного РЭО. Эффективно внедрял результаты научных исследований в практику работы строевых частей ВВС. Активный изобретатель. Достиг значительных успехов в деле подготовки квалифицированных научно-педагогических кадров для НИУ и ВУЗ ВВС. Опытный преподаватель и воспитатель слушателей, умело передавал им свой богатый опыт и знания.

Автор более 160 научных трудов, среди которых 6 монографий, учебники, 10 авторских свидетельств на изобретения.

Подготовил 2 докторов и 19 кандидатов технических наук.

Награжден орденом Красной Звезды и 10 медалями.