В 1940 г. Анатолий Дмитриевич Ботяков окончил среднюю школу и получил рекомендацию для поступления в педагогический институт, но в 1941 г. добровольцем ушел в армию. Участвовал в битве под Москвой. После тяжелого ранения, длительного лечения был демобилизован и вернулся на учебу в педагогический институт. Окончив институт, работал ассистентом на кафедре истории русского языка, где подготовил и защитил кандидатскую диссертацию по древнерусской литературе.

В конце 1940-х гг. А. Д. Ботяков заинтересовался обучением иностранных студентов и написал ряд статей по методике преподавания русского языка как иностранного. Эти статьи были опубликованы в журнале «Русский язык в школе».

В начале 50-х гг., когда ВВИА создавала специальный факультет для обучения иностранных военных специалистов, А. Д. Ботяков был приглашен в академию. В этот период на факультете не существовало ни учебников, ни методических разработок, так как методика преподавания русского как иностранного в те годы еще не была разработана. Не было и опытных преподавателей. Однако собранная А. Д. Ботяковым группа энтузиастов-преподавателей смогла за короткий срок создать целый ряд учебников и профессионально ориентированных учебных пособий для работы с иностранными военными слушателями академии.

Изданные А. Д. Ботяковым «Учебник русского языка для нерусских слушателей авиационных вузов», учебные словари-справочники, учебные программы положили основу для профессионально ориентированной русистики и методики обучения иностранных военных специалистов.

За время тридцатилетнего руководства кафедрой (1956—1986) А. Д. Ботяков неоднократно поощрялся командованием академии и Министерством обороны СССР.

Награжден рядом медалей, среди которых медаль «За отвагу»