После успешной защиты кандидатской диссертации Владимир Николаевич Котовский прошел на кафедре «Теория авиационных двигателей» должности от преподавателя до начальника кафедры (1988—1990). Ученый, квалифицированный методист, В. Н. Котовский имеет большой опыт проведения всех видов занятий по дисциплинам кафедры; его научно-педагогический стаж составляет более 35 лет.

С 1990 по 1999 г. В. Н. Котовский — начальник факультета летательных аппаратов академии. При его активном участии в академии была разработана идеология и программа подготовки летчиков-исследователей для научно-исследовательских организаций ВВС.

В начале 90-х гг. под его руководством и при участии впервые в вузах ВВС была внедрена новая методика выполнения слушателями академии дипломных работ и проектов на основе «безбумажной» технологии с использованием ЭВМ и систем отображения информации.

Автор более 80 трудов, среди которых 4 учебника (в соавторстве), 3 монографии, изобретения, отчеты по НИР.

Им подготовлено 9 кандидатов технических наук. Является членом диссертационных докторских советов академии и ЦИАМ им. П. И. Баранова.

После увольнения из Вооруженных Сил Владимир Николаевич работал профессором кафедры теории авиационных двигателей.

Награжден орденом «За службу Родине в Вооруженных Силах СССР» 3 степени, рядом медалей СССР и РФ.