По окончании училища Геннадий Владимирович Запорожец был направлен в научно-исследовательскую лабораторию ВВИА им. проф. Н. Е. Жуковского. После защиты в качестве соискателя кандидатской диссертации (в 1975 г.) переведен на преподавательскую работу. На должностях заместителя начальника кафедры и начальника кафедры проявил себя умелым руководителем научно- педагогического коллектива. Под его руководством и при активном участии была проведена существенная модернизация учебно-лабораторной базы кафедры, а также созданы и введены в учебный процесс 4 новые специализированные класса РЭБ.

Автор более 200 научных работ, в том числе более 50 учебных пособий для слушателей, курсантов академии и строевых частей. Имеет 10 авторских свидетельств на изобретения.

В последние годы занимается также исследованиями по истории развития РЭБ в Военно-воздушных Силах, издав по этому вопросу 5 книг (2 из них — в соавторстве).

После увольнения из рядов Вооруженных Сил работал старшим научным сотрудником научно-исследовательской лаборатории кафедры РЭБ.

Г. В. Запорожец Федерацией космонавтики России удостоен медалями им. академика Н. А. Пилюгина и им. академика Ю. В. Кондратюка.

Награжден орденом «За службу Родине в Вооруженных Силах СССР» и 12 медалями.