С 1957 по 1978 г. Иван Анисимович Шатских занимал должности преподавателя, старшего преподавателя кафедры оружия массового поражения и защиты от него.

Научное содержание его профессиональной деятельности охватывало широкий круг проблем, связанных с физикой взрыва, физико-техническими основами устройства и поражающего действия авиационных боеприпасов, защитой войск и объектов от оружия массового поражения.

В 1978 г. был привлечен к формированию кафедры вооружения в качестве заместителя начальника кафедры. Внес большой личный вклад в ее создание и становление.

За эти годы стал автором 2 монографий, 5 учебников и многих учебных пособий. Автор и соавтор 75 научных работ.

Являлся ответственным исполнителем 2 Руководств по боевому применению авиационного оружия и ряда научно-исследовательских работ.

Под его научным руководством подготовлено 4 кандидата технических наук.

После увольнения из Вооруженных Сил И. А. Шатских продолжал работать на кафедре вооружения в должности доцента.

Награжден орденом «Знак Почета», медалью «За доблестный труд в Великой Отечественной войне» и другими медалями.