Искандер Салихжанович Хуснетдинов проходил службу в 8 ГНИИ ВВС им. В. П. Чкалова (1983—1989) на должности помощника ведущего инженера. В этот период являлся руководителем бригады по испытанию первой отечественной мобильной автоматизированной системы обработки полетной информации «Маяк-85М» на базе микро-ЭВМ. Принимал участие в испытаниях систем обработки полетной информации Луч-76 К3, Луч-84, «Полярник», а также средств автоматизированного контроля авиационного вооружения «Гурт» и других объектов авиационной техники.

С 1989 по 1993 г. проходил службу в Рижском ВВАИУ на различных инженерных должностях. С 1993 по 1995 г. — адъюнкт ВВИА им. проф. Н. Е. Жуков- ского. С 1995 по 1997 г. — старший научный сотрудник 30 ЦНИИ. С 1997 по 2002 г. — младший научный сотрудник научно-исследовательской лаборатории «Автоматизация контроля и эксплуатационной надежности авиационного оборудования летательных аппаратов» ВВИА, а с 1999 г. возглавил эту лабораторию. В 2000 г. И. С. Хуснетдинов – старший научный сотрудник.

С 2002 по 2008 г. — начальник 3-го отдела научно-исследовательского отдела «Перспективы развития комплексов авиационного оборудования и автоматизированных систем ВВС».

Является автором более 50 научных и научно-методических работ.

Награжден 4 медалями.