С 1995 по 2004 г. Владимир Юрьевич Саламатов занимался вопросами организации кредитно-финансовой деятельности предприятий оборонно-промышленного комплекса и атомной промышленности, в том числе в рамках проектов военно-технического сотрудничества Российской Федерации с иностранными государствами.

В 2002 г. поступил соискателем в докторантуру ВВИА им. проф. Н. Е. Жуковского по кафедре военной экономики и программ вооружения. Докторская диссертация В. Ю. Саламатова посвящена проблемам повышения эффективности и активизации военно-технического сотрудничества предприятий ОПК, в частности, авиационной отрасли.

С 2004 по июнь 2008 г. — в Министерстве промышленности и энергетики Российской Федерации в должностях заместителя директора Департамента финансового контроля и аудита, директора Департамента инвестиционной и инновационной политики, директора Департамента государственной промышленной политики. Занимался широким кругом вопросов по выработке государственной политики в сфере промышленного и оборонно-промышленного комплексов, а также в области развития авиационной техники. Сыграл значительную роль в создании ОАО «Объединенная авиастроительная корпорация», в реализации комплексной целевой программы по созданию перспективного авиационного комплекса фронтовой авиации.

С июня 2008 г. В. Ю. Саламатов — заместитель Министра промышленности и торговли Российской Федерации.

Награжден орденом «Знак Почета», нагрудным знаком «Конструктор стрелкового оружия М. Т. Калашников» за большой личный вклад в продвижение стрелкового оружия на внутренние и внешние рынки. В 2007 г. за большой вклад в проведение экономической политики государства объявлена благодарность Президента Российской Федерации.