До поступления в академию Николай Алексеевич Ермаков был старшим механиком по вооружению военной базы ДВО (1947—1950), курсантом ШМАС ЗабВО (1951 г.), старшим техником по авиавооружению военной приемки (г. Омск, 1951 г.).

После окончания академии — младший преподаватель, научный сотрудник, инженер НИЛ, преподаватель и старший преподаватель специальных кафедр факультета авиавооружения.

Разработал математический аппарат исследования неравновесных газовых потоков, основанный на точных аналитических решениях уравнений Навье— Стокса для структуры фронта ударной волны. Эти исследования явились основой разрешения двух кардинальных проблем боевого применения авиационных комплексов: помпаж двигателей при пуске авиационных ракет и определение путей его устранения, выявление критических тепловых режимов полета воздушно-космических ЛА для выбора рациональных траекторий их маневрирования и спуска в плотных слоях атмосферы.

Автор более 150 научных трудов, в том числе 4 учебников.

После увольнения из рядов Вооруженных Сил работал в качестве профессора на факультете авиавооружения.

Награжден орденом «Знак Почета», медалью «За боевые заслуги» и 12 другими медалями.